Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp1Q8BJQ2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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