Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms