Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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