Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim6Q8BGE7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim6Q8BGE7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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