Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms