Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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