Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt40Q6IFX3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms