Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Pdzrn3Q69ZS0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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