Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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