Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms