Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms