Protein–RNA interactions for Protein: Q61663

Tlx2, T-cell leukemia homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx2Q61663 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlx2Q61663 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlx2Q61663 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlx2Q61663 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms