Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtprnQ60673 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms