Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cdh12Q5RJH3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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