Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms