Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms