Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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