Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nlrc4Q3UP24 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nlrc4Q3UP24 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nlrc4Q3UP24 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nlrc4Q3UP24 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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