Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tmem253Q3UNB8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Tmem253Q3UNB8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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