Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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