Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
InipQ3TXT3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms