Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3TTJ4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3TTJ4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3TTJ4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3TTJ4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms