Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cul4aQ3TCH7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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