Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hddc2Q3SXD3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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