Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

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Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rtl9Q32KG4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rtl9Q32KG4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rtl9Q32KG4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rtl9Q32KG4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rtl9Q32KG4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl9Q32KG4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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