Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnma1Q08460 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms