Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms