Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AsipQ03288 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AsipQ03288 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms