Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms