Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja5Q01231 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja5Q01231 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja5Q01231 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja5Q01231 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms