Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoa1Q00623 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms