Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx1P83917 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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