Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms