Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad23aP54726 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rad23aP54726 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms