Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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