Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VdrP48281 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
VdrP48281 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms