Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VhlP40338 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VhlP40338 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VhlP40338 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms