Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PparaP23204 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PparaP23204 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms