Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms