Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms