Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
UbbP0CG49 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
UbbP0CG49 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms