Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04214 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04214 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04214 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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