Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms