Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1aO89116 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1aO89116 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vti1aO89116 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1aO89116 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1aO89116 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1aO89116 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1aO89116 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1aO89116 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1aO89116 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms