Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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