Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptpn20O55082 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms