Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms