Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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