Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3727J3QM54 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm3727J3QM54 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3727J3QM54 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3727J3QM54 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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