Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms